本センターでは、高大連携事業の一環として文部科学省のスーパーグローバルハイスクール(SGH)プログラムの支援をしています。また、センター教員が個別に小学校や中学校、高等学校においてアフリカの自然や文化、社会、人々の暮らし、アフリカの抱える諸課題―たとえば、経済格差や都市衛生の問題、テロや内戦、民族間の紛争、砂漠化や熱帯林の保全といった講演をおこない、児童や生徒の国際理解に寄与しています。近年では、香川県立丸亀高等学校、滋賀県立膳所高等学校、西南学院高等学校、大阪星光学院高等学校との連携事業があります。近年では、中学や高校で重視されている探究型授業やグループ学習へのアドバイスやサポートも積極的におこなっています。小学生や中学生、高校生がアフリカをはじめ世界に視野を広げるステップになることを願って協力を続けています。